Melola Discovery

← Melola Discovery

Jurnal

Eksplorasi Jenis dan Potensi DNA Barcode Anggrek Thrixspermum Secara In Silico

Jurnal Biodjati · Vol. 3 No. 2 (2018) · hlm. 148–156

DOI
10.15575/biodjati.v3i2.3409
ISSN
2541-4208, 2548-1606
Terbit
2018-11-30
Penerbit
UIN Sunan Gunung Djati Bandung
Bahasa
ind

Abstrak

Thrixspermum merupakan anggrek yang memiliki ciri khas berbunga dalam waktu yang singkat. Akibatnya, dalam pengklasifikasian menggunakan morfologi cenderung sulit untuk dilakukan. Sehingga perlu adanya pengklasifikasian menggunakan cara alternatif misalnya dengan marka molekuler menggunakan DNA. Tujuan dari penelitian ini adalah mencari barkode DNA dari beberapa spesies Thrixspermum yang ada pada GenBank NCBI. Berdasarkan data dari NCBI, hanya terdapat 19 spesies dari genus Thrixspermum yang telah diteliti sekuennya. Dari total 19 spesies tersebut, setelah dilakukan pensejajaran sekuen menunjukkan bahwa pada lokus matK dan rbcL memiliki tingkat homologi yang tinggi, sementara pada lokus ITS menunjukkan lebih banyak variasi genetik. Terdapat dua spesies yakni T. annamense dan T. marguense yang berpotensi memiliki barcode pada lokus ITS. Selain itu, didapatkan pohon filogenetik dari 19 spesies Thrixspermum yang telah diketahui senkuennya pada NCBI. Â

Kata kunci

Jaringan kolaborasi para penulis

6 penulis · 15 tautan kepenulisan bersama

Arahkan kursor atau ketuk sebuah nama untuk menyorot rekan penulisnya. Klik dua kali untuk membuka halaman penulis.

  • Universitas Jember
  • Afiliasi tidak diketahui
  • Organisasi berbeda
  • Organisasi sama
  • Afiliasi tidak diketahui
  • Garis lebih tebal = lebih banyak artikel bersama · lingkaran lebih besar = lebih banyak artikel
Tampilkan sebagai tabel
Rekan penulisOrganisasiArtikel bersama

Afiliasi berasal dari OpenAlex; metadata OAI-PMH jurnal tidak memuatnya. Penulis tanpa ID OpenAlex dicocokkan berdasarkan nama, sehingga dua orang bisa tergabung atau satu orang bisa terpisah.

Sumber metadata: OAI-PMH (metadata jurnal) https://journal.uinsgd.ac.id/index.php/biodjati/oai, pertama di-harvest 7 Nov 2026, terakhir terlihat 8 Nov 2026.
Metadata asli (oai_dc) 
<oai_dc:dc xmlns="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/  http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
	<dc:title xml:lang="id-ID">Eksplorasi Jenis dan Potensi DNA Barcode Anggrek Thrixspermum Secara In Silico</dc:title>
	<dc:creator>Rohimah, Siti</dc:creator>
	<dc:creator>Mukarramah, Luluk</dc:creator>
	<dc:creator>Sindiya, Vita</dc:creator>
	<dc:creator>S., Veren Yuliana,</dc:creator>
	<dc:creator>K., Gita Ayu,</dc:creator>
	<dc:creator>Su’udi, Mukhamad</dc:creator>
	<dc:subject xml:lang="id-ID">Thrixspermum</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="id-ID">ITS</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="id-ID">pohon filogenetik</dc:subject>
	<dc:description xml:lang="id-ID">Thrixspermum merupakan anggrek yang memiliki ciri khas berbunga dalam waktu yang singkat. Akibatnya, dalam pengklasifikasian menggunakan morfologi cenderung sulit untuk dilakukan. Sehingga perlu adanya pengklasifikasian menggunakan cara alternatif misalnya dengan marka molekuler menggunakan DNA. Tujuan dari penelitian ini adalah mencari barkode DNA dari beberapa spesies Thrixspermum yang ada pada GenBank NCBI. Berdasarkan data dari NCBI, hanya terdapat 19 spesies dari genus Thrixspermum yang telah diteliti sekuennya. Dari total 19 spesies tersebut, setelah dilakukan pensejajaran sekuen menunjukkan bahwa pada lokus matK dan rbcL memiliki tingkat homologi yang tinggi, sementara pada lokus ITS menunjukkan lebih banyak variasi genetik. Terdapat dua spesies yakni T. annamense dan T. marguense yang berpotensi memiliki barcode pada lokus ITS. Selain itu, didapatkan pohon filogenetik dari 19 spesies Thrixspermum yang telah diketahui senkuennya pada NCBI.  </dc:description>
	<dc:publisher xml:lang="en-US">UIN Sunan Gunung Djati Bandung</dc:publisher>
	<dc:date>2018-11-30</dc:date>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/article</dc:type>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
	<dc:type xml:lang="en-US">Peer-reviewed Article</dc:type>
	<dc:format>application/pdf</dc:format>
	<dc:identifier>https://journal.uinsgd.ac.id/index.php/biodjati/article/view/3409</dc:identifier>
	<dc:identifier>10.15575/biodjati.v3i2.3409</dc:identifier>
	<dc:source xml:lang="en-US">Jurnal Biodjati; Vol. 3 No. 2 (2018): November; 148-156</dc:source>
	<dc:source xml:lang="id-ID">Jurnal Biodjati; Vol 3 No 2 (2018): November; 148-156</dc:source>
	<dc:source>2541-4208</dc:source>
	<dc:source>2548-1606</dc:source>
	<dc:language>ind</dc:language>
	<dc:relation>https://journal.uinsgd.ac.id/index.php/biodjati/article/view/3409/2192</dc:relation>
	<dc:rights xml:lang="en-US">Copyright (c) 2018 Jurnal Biodjati</dc:rights>
</oai_dc:dc>