Genetic variability in 12 butterfly pea (Clitoria ternatea L.) accessions: a dual approach with cluster and principal component analysis

Algina, Azka; Ustari, Debby; Wicaksono, Arif Affan; Concibido, Vergel; Karuniawan, Agung

doi:10.15575/37117

Jurnal

Genetic variability in 12 butterfly pea (Clitoria ternatea L.) accessions: a dual approach with cluster and principal component analysis

Jurnal AGRO · Vol. 11 No. 2 (2025) · hlm. 29–44

DOI: 10.15575/37117
ISSN: 2407-7933
Terbit: 2025-01-03
Penerbit: Jurusan Agroteknologi
Bahasa: eng

Abstrak

Understanding genetic variability is crucial for enhancing the breeding programs of butterfly pea (Clitoria ternatea L.), particularly in the face of the demand for improved crop varieties. This study aims to (i) evaluate the genetic variability of 12 butterfly pea accessions based on 28 agro-morphological traits and (ii) analyze the genetic relationships among these accessions. The research was conducted from December 2022 to October 2023 at the Ciparanje Experimental Field, Faculty of Agriculture, Universitas Padjadjaran. The experimental design employed a Randomized Complete Block Design (RCBD) with 12 accessions and three replications. Observations were made on 28 agro-morphological traits. Data analysis was performed using analysis of variance (ANOVA), principal component analysis (PCA), and agglomerative hierarchical clustering (AHC). ANOVA results indicated significant diversity among the 12 accessions based on 17 agro-morphological traits. PCA results showed that the first six principal components accounted for 89.1% of the total genetic variability and identified all traits as contributing factors to the genetic variability among the accessions. AHC analysis grouped the accessions into two main clusters, with Euclidean distances ranging from 1.00 to 4.00, indicating varying levels of genetic relatedness. These findings underscore the importance of genetic variability in formulating breeding strategies, particularly in the selection of parents based on targeted agro-morphological traits. ABSTRAK Informasi keragaman genetik sangat penting untuk mendukung program pemuliaan tanaman telang (Clitoria ternatea L.), khususnya dalam menghadapi permintaan varietas unggul. Penelitian ini bertujuan untuk (i) mengevaluasi keragaman genetik dari 12 aksesi kembang telang berdasarkan 28 karakter agro-morfologi dan (ii) menganalisis hubungan genetik di antara aksesi-aksesi tersebut berdasarkan 28 karakter agro-morfologi. Penelitian dilaksanakan pada Desember 2022 hingga Oktober 2023 di Kebun Percobaan Ciparanje, Fakultas Pertanian, Universitas Padjadjaran. Desain eksperimen menggunakan Rancangan Acak Kelompok Lengkap (RAKL) dengan 12 aksesi dan tiga ulangan. Pengamatan dilakukan pada 28 karakter agro-morfologi. Analisis data dilakukan dengan analisis varians (ANOVA), analisis komponen utama (PCA), dan pengelompokan hierarki aglomeratif (AHC). Hasil analisis ANOVA menunjukkan bahwa 12 aksesi telang beragam secara signifikan berdasarkan 17 karakter agro-morfologi. Hasil PCA menunjukkan bahwa enam komponen utama pertama menjelaskan 89,1% dari total keragaman genetik dan mengidentifikasi 28 karakter agro-morfologi sebagai karakter yang berkontribusi terhadap keragaman genetik 12 aksesi telang. Analisis AHC mengelompokkan 12 aksesi menjadi dua kelompok utama dengan jarak Euclidean berkisar antara 1,00 hingga 4,00, mengindikasikan tingkat kekerabatan genetik yang jauh. Temuan ini menegaskan pentingnya keragaman genetik dalam merumuskan strategi pemuliaan yang efektif, terutama dalam pemilihan tetua berdasarkan karakter agro-morfologi yang ditargetkan.

Kata kunci

Jaringan kolaborasi para penulis

34 penulis · 106 tautan kepenulisan bersama

Arahkan kursor atau ketuk sebuah nama untuk menyorot rekan penulisnya. Klik dua kali untuk membuka halaman penulis.

Afiliasi tidak diketahui

Organisasi berbeda
Organisasi sama
Afiliasi tidak diketahui
Garis lebih tebal = lebih banyak artikel bersama · lingkaran lebih besar = lebih banyak artikel

Tampilkan sebagai tabel

Rekan penulis	Organisasi	Artikel bersama
Ade Ismail	Afiliasi tidak diketahui	4
Pujawati Suryatmana	Afiliasi tidak diketahui	3
Kintan Widya Pangestika	Afiliasi tidak diketahui	3
Reginawanti Hindersah	Afiliasi tidak diketahui	2
Rija Sudirja	Afiliasi tidak diketahui	2
Emma Trinurani Sofyan	Afiliasi tidak diketahui	2
Rhazista Noviardi	Afiliasi tidak diketahui	2
Neni Rostini	Afiliasi tidak diketahui	2
Reviana Aulia	Afiliasi tidak diketahui	2
Haris Maulana	Afiliasi tidak diketahui	2
Acep Atma Wijaya	Afiliasi tidak diketahui	1
Hana D Rahayu	Afiliasi tidak diketahui	1
Adi R. H. Oksifa	Afiliasi tidak diketahui	1
Meddy Rachmadi	Afiliasi tidak diketahui	1
Andina Chotimah	Afiliasi tidak diketahui	1
Asana Matsuura	Afiliasi tidak diketahui	1
Yeni Wispa Dewi	Afiliasi tidak diketahui	1
Yuyun Yuwariah	Afiliasi tidak diketahui	1
Dedi Ruswandi	Afiliasi tidak diketahui	1
Fakhri Nasharul Syihab	Afiliasi tidak diketahui	1
Dwi Susanto	Afiliasi tidak diketahui	1
Yenny Muliani	Afiliasi tidak diketahui	1
Ida Adviany	Afiliasi tidak diketahui	1
Neng Tita Nursinta	Afiliasi tidak diketahui	1
Yusup Hidayat	Afiliasi tidak diketahui	1
Vera Oktavia Subarja	Afiliasi tidak diketahui	1
Mieke Rochimi Setiawati	Afiliasi tidak diketahui	1
Benny Joy	Afiliasi tidak diketahui	1
Muhamad Rachman Djuwansah	Afiliasi tidak diketahui	1

Afiliasi berasal dari OpenAlex; metadata OAI-PMH jurnal tidak memuatnya. Penulis tanpa ID OpenAlex dicocokkan berdasarkan nama, sehingga dua orang bisa tergabung atau satu orang bisa terpisah.

Sumber metadata: OAI-PMH (metadata jurnal) https://journal.uinsgd.ac.id/index.php/ja/oai, pertama di-harvest 7 Nov 2026, terakhir terlihat 8 Nov 2026.

Metadata asli (oai_dc)

<oai_dc:dc xmlns="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/  http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
	<dc:title xml:lang="en-US">Genetic variability in 12 butterfly pea (Clitoria ternatea L.) accessions: a dual approach with cluster and principal component analysis</dc:title>
	<dc:creator>Algina, Azka</dc:creator>
	<dc:creator>Ustari, Debby</dc:creator>
	<dc:creator>Wicaksono, Arif Affan</dc:creator>
	<dc:creator>Concibido, Vergel</dc:creator>
	<dc:creator>Karuniawan, Agung</dc:creator>
	<dc:subject xml:lang="en-US">cluster analysis</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en-US">Euclidean</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en-US">genetic distance</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en-US">high-yield</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en-US">parent line</dc:subject>
	<dc:description xml:lang="en-US">Understanding genetic variability is crucial for enhancing the breeding programs of butterfly pea (Clitoria ternatea L.), particularly in the face of the demand for improved crop varieties. This study aims to (i) evaluate the genetic variability of 12 butterfly pea accessions based on 28 agro-morphological traits and (ii) analyze the genetic relationships among these accessions. The research was conducted from December 2022 to October 2023 at the Ciparanje Experimental Field, Faculty of Agriculture, Universitas Padjadjaran. The experimental design employed a Randomized Complete Block Design (RCBD) with 12 accessions and three replications. Observations were made on 28 agro-morphological traits. Data analysis was performed using analysis of variance (ANOVA), principal component analysis (PCA), and agglomerative hierarchical clustering (AHC). ANOVA results indicated significant diversity among the 12 accessions based on 17 agro-morphological traits. PCA results showed that the first six principal components accounted for 89.1% of the total genetic variability and identified all traits as contributing factors to the genetic variability among the accessions. AHC analysis grouped the accessions into two main clusters, with Euclidean distances ranging from 1.00 to 4.00, indicating varying levels of genetic relatedness. These findings underscore the importance of genetic variability in formulating breeding strategies, particularly in the selection of parents based on targeted agro-morphological traits.

ABSTRAK

Informasi keragaman genetik sangat penting untuk mendukung program pemuliaan tanaman telang (Clitoria ternatea L.), khususnya dalam menghadapi permintaan varietas unggul. Penelitian ini bertujuan untuk (i) mengevaluasi keragaman genetik dari 12 aksesi kembang  telang  berdasarkan  28  karakter  agro-morfologi  dan  (ii)  menganalisis  hubungan genetik di antara aksesi-aksesi tersebut berdasarkan 28 karakter agro-morfologi. Penelitian dilaksanakan pada Desember 2022 hingga Oktober 2023 di Kebun Percobaan Ciparanje, Fakultas Pertanian, Universitas Padjadjaran. Desain eksperimen menggunakan Rancangan Acak Kelompok Lengkap (RAKL) dengan 12 aksesi dan tiga ulangan. Pengamatan dilakukan pada 28 karakter agro-morfologi. Analisis data dilakukan dengan analisis varians (ANOVA), analisis komponen utama (PCA), dan pengelompokan hierarki aglomeratif (AHC). Hasil analisis ANOVA menunjukkan bahwa 12 aksesi telang beragam secara signifikan berdasarkan 17 karakter agro-morfologi. Hasil PCA menunjukkan bahwa enam komponen utama pertama menjelaskan 89,1% dari total keragaman genetik dan mengidentifikasi 28 karakter agro-morfologi sebagai karakter yang berkontribusi terhadap keragaman genetik 12 aksesi telang.  Analisis AHC mengelompokkan 12 aksesi menjadi dua kelompok utama dengan jarak Euclidean berkisar antara 1,00 hingga 4,00, mengindikasikan tingkat kekerabatan genetik yang jauh. Temuan ini menegaskan pentingnya keragaman genetik dalam merumuskan strategi pemuliaan yang efektif, terutama dalam pemilihan tetua berdasarkan karakter agro-morfologi yang ditargetkan.</dc:description>
	<dc:publisher xml:lang="en-US">Jurusan Agroteknologi</dc:publisher>
	<dc:date>2025-01-03</dc:date>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/article</dc:type>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
	<dc:format>application/pdf</dc:format>
	<dc:identifier>https://journal.uinsgd.ac.id/index.php/ja/article/view/37117</dc:identifier>
	<dc:identifier>10.15575/37117</dc:identifier>
	<dc:source xml:lang="en-US">Jurnal AGRO; Vol. 11 No. 2 (2024); 29-44</dc:source>
	<dc:source>2407-7933</dc:source>
	<dc:language>eng</dc:language>
	<dc:relation>https://journal.uinsgd.ac.id/index.php/ja/article/view/37117/pdf</dc:relation>
	<dc:rights xml:lang="en-US">Copyright (c) 2025 Azka Algina, Debby Ustari, Arif Affan Wicaksono, Tarkus Suganda, Vergel Concibido, Agung Karuniawan</dc:rights>
</oai_dc:dc>