Melola Discovery

← Melola Discovery

Jurnal SINTA 1

Cloning of Genomic DNA Flanking Transposon in the Nonpathogenic Mutant of Xanthomonas axonopodis pv. glycines M715

HAYATI Journal of Biosciences · Vol. 12 No. 2 (2009)

DOI
10.4308/hjb.12.2.57
ISSN
2086-4094, 1978-3019
Terbit
2009-11-30
Penerbit
Bogor Agricultural University, Indonesia
Bahasa
eng

Abstrak

The objective of this work is to clone flanking DNA derived from Tn-5 mutagenesis of wild type strain Xanthomonas axonopodis pv. glycines as first step to clone and to identify the gene involved in pathogenicity mechanism. We have localized the flanking DNA fragment from a nonpathogenic mutant of Xag M715. Southern hybridization analysis using 2.8 kb EcoRI from pYR103 as a probe showed that the fragment is located within 2.0 kb PstI fragment. A 0.7 kb flanking DNA was amplified using inverse PCR technique, and inserted into pGEM-T Easy vector generating a 3.7 kb recombinant plasmid (pAA01). Southern hybridization analysis of the wild type (YR32) with pAA01 as a probe indicated a hybridization signal located at approximately 3.0 kb PstI fragment. DNA sequence analysis revealed that the DNA fragment has a 64% identity to a vir gene of Bacillus anthracis.

Jaringan kolaborasi para penulis

40 penulis · 101 tautan kepenulisan bersama · menampilkan 40 yang paling banyak terhubung

Arahkan kursor atau ketuk sebuah nama untuk menyorot rekan penulisnya. Klik dua kali untuk membuka halaman penulis.

  • IPB University
  • Institut Agama Islam Negeri Kendari
  • Afiliasi tidak diketahui
  • Organisasi berbeda
  • Organisasi sama
  • Afiliasi tidak diketahui
  • Garis lebih tebal = lebih banyak artikel bersama · lingkaran lebih besar = lebih banyak artikel
Tampilkan sebagai tabel
Rekan penulisOrganisasiArtikel bersama
ESTI PUSPITASARIAfiliasi tidak diketahui4
Iman RusmanaAfiliasi tidak diketahui4
Nisa Rachmania MubarikAfiliasi tidak diketahui4
Dwi SuryantoAfiliasi tidak diketahui3
Anja MeryandiniAfiliasi tidak diketahui3
Aris Tri WahyudiIPB University3
Andreas Adhi SatyaAfiliasi tidak diketahui3
AMARILA MALIKAfiliasi tidak diketahui3
Nizirwan AnwarAfiliasi tidak diketahui2
Widanarni WidanarniIPB University2
Yulin LestariAfiliasi tidak diketahui2
Cecilia Anna SeumahuAfiliasi tidak diketahui2
Dedy Duryadi SolihinAfiliasi tidak diketahui2
TATI BARUSAfiliasi tidak diketahui2
Maria Indah PurnamasariAfiliasi tidak diketahui2
Rika Indri AstutiAfiliasi tidak diketahui2
Yepy Hardi RustamAfiliasi tidak diketahui2
ROB HARLINGAfiliasi tidak diketahui2
M. Dzulfiqar FirdausAfiliasi tidak diketahui1
Ummanah UmmanahAfiliasi tidak diketahui1
Haris FebriantoAfiliasi tidak diketahui1
Malabay MalabayAfiliasi tidak diketahui1
Destian GilangAfiliasi tidak diketahui1
Kundang KarsonoAfiliasi tidak diketahui1
Shofiyul MillahAfiliasi tidak diketahui1
Richard EvansAfiliasi tidak diketahui1
Dadang HermawanAfiliasi tidak diketahui1
Nurul AiniInstitut Agama Islam Negeri Kendari1
WALTER ERDELENAfiliasi tidak diketahui1
Yusminah HalaAfiliasi tidak diketahui1
Ridwan AffandiAfiliasi tidak diketahui1
MUHAMMAD ZAIRIN Jr.Afiliasi tidak diketahui1
SumardiAfiliasi tidak diketahui1
MAGGY T HENAWIDJAJAAfiliasi tidak diketahui1
T RESNAWATI P URWADARIAAfiliasi tidak diketahui1
ROHANI CINTA BADIA GINTINGAfiliasi tidak diketahui1
ARIS TJAHJOLEKSONOAfiliasi tidak diketahui1

Afiliasi berasal dari OpenAlex; metadata OAI-PMH jurnal tidak memuatnya. Penulis tanpa ID OpenAlex dicocokkan berdasarkan nama, sehingga dua orang bisa tergabung atau satu orang bisa terpisah.

Sumber metadata: OAI-PMH (metadata jurnal) http://journal.ipb.ac.id/index.php/hayati/oai, pertama di-harvest 8 Nov 2026, terakhir terlihat 8 Nov 2026.
Metadata asli (oai_dc) 
<oai_dc:dc xmlns="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/  http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
	<dc:title xml:lang="en">Cloning of Genomic DNA Flanking Transposon in the Nonpathogenic Mutant of Xanthomonas axonopodis pv. glycines M715</dc:title>
	<dc:creator xml:lang="en">RUSMANA, ALINA AKHDIYA</dc:creator>
	<dc:creator xml:lang="en">SUWANTO, ANTONIUS</dc:creator>
	<dc:creator xml:lang="en">TJAHJONO, BUDI</dc:creator>
	<dc:description xml:lang="en">The objective of this work is to clone flanking DNA derived from Tn-5 mutagenesis of wild type strain Xanthomonas axonopodis pv. glycines as first step to clone and to identify the gene involved in pathogenicity mechanism. We have localized the flanking DNA fragment from a nonpathogenic mutant of Xag M715. Southern hybridization analysis using 2.8 kb EcoRI from pYR103 as a probe showed that the fragment is located within 2.0 kb PstI fragment. A 0.7 kb flanking DNA was amplified using inverse PCR technique, and inserted into pGEM-T Easy vector generating a 3.7 kb recombinant plasmid (pAA01). Southern hybridization analysis of the wild type (YR32) with pAA01 as a probe indicated a hybridization signal located at approximately 3.0 kb PstI fragment. DNA sequence analysis revealed that the DNA fragment has a 64% identity to a vir gene of Bacillus anthracis.</dc:description>
	<dc:publisher xml:lang="en">Bogor Agricultural University, Indonesia</dc:publisher>
	<dc:date>2009-11-30</dc:date>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/article</dc:type>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
	<dc:type xml:lang="en">Peer-reviewed Article</dc:type>
	<dc:format>application/pdf</dc:format>
	<dc:identifier>http://journal.ipb.ac.id/hayati/article/view/173</dc:identifier>
	<dc:identifier>10.4308/hjb.12.2.57</dc:identifier>
	<dc:source xml:lang="en">HAYATI Journal of Biosciences; Vol. 12 No. 2 (2005): June 2005; 57</dc:source>
	<dc:source>2086-4094</dc:source>
	<dc:source>1978-3019</dc:source>
	<dc:language>eng</dc:language>
	<dc:relation>http://journal.ipb.ac.id/hayati/article/view/173/40</dc:relation>
</oai_dc:dc>