Melola Discovery

← Melola Discovery

Jurnal

Analisis Hidden Markov Model untuk Segmentasi Barisan DNA

Jurnal Matematika, Statistika dan Komputasi · Vol. 13 No. 1 (2018) · hlm. 55–65

DOI
10.20956/jmsk.v13i1.3484
ISSN
2614-8811, 1858-1382
Terbit
2018-02-05
Penerbit
Department of Mathematics, Hasanuddin University
Bahasa
en

Abstrak

Barisan DNA merupakan barisan yang terdiri dari basa Adenin (A), Sitosin (C), Timin (T), dan Guanin (G) yang diulang ribuan hingga jutaan kali dalam genom. Pada barisan ini, dilakukan analisis segmentasi DNA untuk mengidentifikasi dan memprediksikan pola kemunculan basa A, C, T, dan G. Pada penelitian ini, analisis segmentasi barisan DNA dilakukan dengan menggunakan model Hidden Markov Model (HMM) orde pertama yang merupakan sebuah model statistik dari sebuah sistem yang diasumsikan sebagai suatu proses Markov dengan parameter yang tak diketahui dan tantangannya adalah menentukan parameter tersembunyi (hidden) dari parameter yang dapat diamati. HMM orde pertama berarti bahwa peluang munculnya suatu basa A, C, T, dan G, hanya dipengaruhi oleh satu basa sebelumnya. Dari hasil HMM pada penelitian ini yang merupakan suatu matriks peluang transisi, diperoleh nilai peluang terbesar adalah proses perpindahan basa Guanin (G) ke Adenin (A) dengan nilai peluang 0,434 dan nilai peluang terkecil adalah perpindahan basa Sitosin (C) ke Guanin (G) dengan nilai peluang 0,072. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah data barisan DNA Homo sapiens (manusia), yang merupakan salah satu database barisan DNA pada GenBank.

Jaringan kolaborasi para penulis

40 penulis · 108 tautan kepenulisan bersama · 2 lintas organisasi · menampilkan 40 yang paling banyak terhubung

Arahkan kursor atau ketuk sebuah nama untuk menyorot rekan penulisnya. Klik dua kali untuk membuka halaman penulis.

  • Hasanuddin University
  • Universitas Gadjah Mada
  • Afiliasi tidak diketahui
  • Organisasi berbeda
  • Organisasi sama
  • Afiliasi tidak diketahui
  • Garis lebih tebal = lebih banyak artikel bersama · lingkaran lebih besar = lebih banyak artikel
Tampilkan sebagai tabel
Rekan penulisOrganisasiArtikel bersama
Raupong RaupongHasanuddin University6
Anna IslamiyatiHasanuddin University4
Nirwan IlyasHasanuddin University3
Nasrah SirajangHasanuddin University3
La Podje TalangkoHasanuddin University2
Saleh AfAfiliasi tidak diketahui2
Erna Tri HerdianiHasanuddin University2
Widya Nauli Amalia PuteriHasanuddin University1
Nirwan IlyasAfiliasi tidak diketahui1
Bunga ApriliaHasanuddin University1
R KhaeratiHasanuddin University1
Grace Oktavia YusufAfiliasi tidak diketahui1
Azman AzmanHasanuddin University1
Fitriatusakiah FitriatusakiahAfiliasi tidak diketahui1
Andi Tenri Riski AmaliaAfiliasi tidak diketahui1
Georgina Maria TinungkiHasanuddin University1
Andi Isna YunitaHasanuddin University1
Alimatun NajihaHasanuddin University1
Anisa AnisaAfiliasi tidak diketahui1
Reski AmalahAfiliasi tidak diketahui1
NUR FUADIL MAQNUNAfiliasi tidak diketahui1
Nurtit SunusiAfiliasi tidak diketahui1
Ainul FajriAfiliasi tidak diketahui1
Sitti SahrimanHasanuddin University1
Anisa Haura Salsa Fatih YusufAfiliasi tidak diketahui1
Nurtiti SunusiHasanuddin University1
Ika Pratiwi HayaAfiliasi tidak diketahui1
Andi Ummi Melin AichaAfiliasi tidak diketahui1
Wa Ode Sitti Amni AmniAfiliasi tidak diketahui1
Sitti SahrimanAfiliasi tidak diketahui1
Amalia AndrianingrumAfiliasi tidak diketahui1
Muhammad ZakirHasanuddin University1
Muhammad Jayzul UsrahHasanuddin University1
Ummi SariHasanuddin University1
Fajar AffanHasanuddin University1
Fadhila Febriyanti NajamuddinHasanuddin University1
Himawan HimawanAfiliasi tidak diketahui1

Afiliasi berasal dari OpenAlex; metadata OAI-PMH jurnal tidak memuatnya. Penulis tanpa ID OpenAlex dicocokkan berdasarkan nama, sehingga dua orang bisa tergabung atau satu orang bisa terpisah.

Sumber metadata: OAI-PMH (metadata jurnal) https://journal.unhas.ac.id/index.php/jmsk/oai, pertama di-harvest 5 Nov 2026, terakhir terlihat 8 Nov 2026.
Metadata asli (oai_dc) 
<oai_dc:dc xmlns="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/  http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
	<dc:title xml:lang="en">Analisis Hidden Markov Model untuk  Segmentasi Barisan DNA</dc:title>
	<dc:creator xml:lang="en">Anisa, Anisa</dc:creator>
	<dc:creator xml:lang="en">Jaya, Andi Kresna</dc:creator>
	<dc:creator xml:lang="en">Sunarti, Sunarti</dc:creator>
	<dc:description xml:lang="en">Barisan DNA merupakan barisan yang terdiri dari basa Adenin (A), Sitosin (C), Timin (T), dan Guanin (G) yang diulang ribuan hingga jutaan kali dalam genom. Pada barisan ini, dilakukan analisis segmentasi DNA untuk mengidentifikasi dan memprediksikan pola kemunculan basa A, C, T, dan G. Pada penelitian ini, analisis segmentasi barisan DNA dilakukan dengan menggunakan model Hidden Markov Model (HMM) orde pertama yang merupakan sebuah model statistik dari sebuah sistem yang diasumsikan sebagai suatu proses Markov dengan parameter yang tak diketahui  dan tantangannya adalah menentukan parameter tersembunyi (hidden) dari parameter yang dapat diamati . HMM orde pertama berarti bahwa peluang munculnya suatu basa A, C, T, dan G, hanya dipengaruhi oleh satu basa sebelumnya. Dari hasil HMM pada penelitian ini yang merupakan suatu matriks peluang transisi, diperoleh nilai peluang terbesar adalah proses perpindahan basa Guanin (G) ke Adenin (A) dengan nilai peluang 0,434 dan nilai peluang  terkecil adalah perpindahan basa Sitosin (C) ke Guanin (G) dengan nilai peluang 0,072. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah data barisan DNA Homo sapiens (manusia), yang merupakan salah satu database barisan DNA pada GenBank.</dc:description>
	<dc:publisher xml:lang="en">Department of Mathematics, Hasanuddin University</dc:publisher>
	<dc:date>2018-02-05</dc:date>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/article</dc:type>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
	<dc:format>application/pdf</dc:format>
	<dc:identifier>https://journal.unhas.ac.id/index.php/jmsk/article/view/3484</dc:identifier>
	<dc:identifier>10.20956/jmsk.v13i1.3484</dc:identifier>
	<dc:source xml:lang="en">Jurnal Matematika, Statistika dan Komputasi; Vol. 13 No. 1: July 2016; 55-65</dc:source>
	<dc:source>2614-8811</dc:source>
	<dc:source>1858-1382</dc:source>
	<dc:language>en</dc:language>
	<dc:relation>https://journal.unhas.ac.id/index.php/jmsk/article/view/3484/2007</dc:relation>
	<dc:relation>10.20956/j.v13i1.3484.g2007</dc:relation>
	<dc:rights xml:lang="en">Copyright (c) 2018 Anisa Anisa, Andi Kresna Jaya, Sunarti Sunarti</dc:rights>
</oai_dc:dc>