Melola Discovery

← Melola Discovery

Open access Jurnal

Log-Rank Test as A Continuation of The Kaplan-Meier Method in Survival Analysis Using R Language (Case Study: D-penicillamine Treatment on the Probabillity of Survival in Primary Biliary Cirrhosis (PBC) Patients at the Mayo Clinic)

LOG-RANK TEST SEBAGAI LANJUTAN DARI METODE KAPLAN-MEIER DALAM ANALISIS SURVIVAL MENGGUNAKAN BAHASA R (Studi Kasus: Treatment D-penicillamine terhadap Peluang Tahan Hidup Pasien Primary Biliary Cirrhosis (PBC) di Mayo Clinic)

Jurnal Matematika, Statistika dan Komputasi · Vol. 21 No. 1 (2024) · pp. 285–306

DOI
10.20956/j.v21i1.36073
ISSN
2614-8811, 1858-1382
Published
2024-09-15
Publisher
Department of Mathematics, Hasanuddin University
Language
en
License
creativecommons.org/licenses/by/4.0

Abstract

English

From 1974 to 1984, Mayo Clinic conducted a D-penicillamine trial to improve the chances of survival of PBC patients. Mayo Clinic conducted a randomized placebo-controlled trial on patients to compare D-penicillamine with D-penicillamine. Mayo Clinic considered other variables besides the time of death or censored time in its study, namely the variables of Ascites, Hepatomegaly, Spider or the presence of esophageal varices, and other PBC symptom variables. Therefore, the author conducted this study to find out D-penicillamine as a drug treatment for PBC by only looking at the variable of time of death or censored time and the variable of drug treatment received by patients during the ten-year data collection period and completing the study with statistical science. Based on that, the author used survival analysis with the Kaplan-Meier and Log-Rank methods to find D-penicillamine as a PBC drug treatment. This study shows how to complete the analysis using the R language. The study results showed that D-penicillamine treatment was not good enough to increase the survival chances of PBC patients

Bahasa Indonesia

Pada tahun 1974 hingga 1984, Mayo Clinic mengumpulkan 424 pasien pengidap Primary Biliary Cirrhosis (PBC) untuk menguji apakah D-penicillamine dapat meningkatkan peluang tahan hidup pasien pengidap PBC. Mayo Clinic melakukan uji coba acak terkontrol placebo sebagai pembanding untuk D-penicillamine. Selain itu, terdapat pasien yang tidak diketahui treatment yang diberikan, tetapi tetap diobservasi sebagai pembanding sehingga terdapat tiga kelompok pasien pada penelitian tersebut, yakni pasien yang diberi treatment D-penicillamine, placebo, dan NA (pasien tidak diketahui treatment yang diberikan). Mayo Clinic memperhatikan variabel lain selain waktu kematian atau pun waktu tersensor pada penelitiannya, yaitu variabel gejala Asites, Hepatomegali, Spider atau adanya varises esofagus, dan variabel gejala PBC lainnya. Penulis melakukan penelitian pada skripsi ini dengan tujuan untuk mengetahui D-penicillamine sebagai treatment obat untuk penyakit PBC dengan hanya melihat variabel waktu kematian atau waktu tersensor dan variabel treatment obat yang didapatkan pasien selama masa pengumpulan data rentang sepuluh tahun tersebut serta menyelesaikan penelitian dengan ilmu statistika. Berdasarkan hal itu, penulis menggunakan analisis survival dengan metode Kaplan-Meier dan Log-Rank untuk mengetahui D-penicillamine sebagai treatment obat untuk penyakit PBC. Penelitian ini menunjukkan cara penyelesaian analisis tersebut menggunakan bahasa R. Hasil dari penelitian menunjukkan bahwa treatment D-penicillamine tidak cukup baik dalam meningkatkan peluang tahan hidup pasien pengidap PBC.

Keywords

Collaboration network of the authors

16 authors · 26 co-authorship links

Hover or tap a name to highlight its co-authors. Double-click to open the author's page.

  • Syarif Hidayatullah State Islamic University Jakarta
  • Affiliation unknown
  • Different organisations
  • Same organisation
  • Affiliation unknown
  • Thicker line = more joint articles · bigger circle = more articles
Show as table
Co-authorOrganisationJoint articles
Ery IswaryAffiliation unknown2
Yusriadi YusriadiAffiliation unknown1
Asriani AbbasAffiliation unknown1
Rahmat SuloAffiliation unknown1
Tadjuddin MaknunAffiliation unknown1
Nurul Mawaddah Ayu PutriAffiliation unknown1
Kamsinah KamsinahAffiliation unknown1
Eva EvianiAffiliation unknown1
Noer Jihad SalehAffiliation unknown1
isnaeni isnaeniAffiliation unknown1
Andi Alimuddin UndeAffiliation unknown1
Syamsul RijalSyarif Hidayatullah State Islamic University Jakarta1
Muhammad HasyimAffiliation unknown1

Affiliations come from OpenAlex; journal OAI-PMH metadata carries none. Authors without an OpenAlex ID are matched by name, which can merge or split people.

Metadata source: OAI-PMH (metadata jurnal) https://journal.unhas.ac.id/index.php/jmsk/oai, first harvested 5 Nov 2026, last seen 5 Nov 2026.
Original metadata (oai_dc) 
<oai_dc:dc xmlns="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/  http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
	<dc:title xml:lang="en">Log-Rank Test as A Continuation of The Kaplan-Meier Method in Survival Analysis Using R Language (Case Study: D-penicillamine Treatment on the Probabillity of Survival in Primary Biliary Cirrhosis (PBC) Patients at the Mayo Clinic)</dc:title>
	<dc:title xml:lang="id">LOG-RANK TEST SEBAGAI LANJUTAN DARI METODE  KAPLAN-MEIER DALAM ANALISIS SURVIVAL  MENGGUNAKAN BAHASA R (Studi Kasus: Treatment D-penicillamine terhadap Peluang Tahan Hidup Pasien Primary Biliary Cirrhosis (PBC) di Mayo Clinic)</dc:title>
	<dc:creator xml:lang="en">Putri, Ferennia </dc:creator>
	<dc:creator xml:lang="en">Martadiputra, BAP </dc:creator>
	<dc:creator xml:lang="en">Lukman, Lukman</dc:creator>
	<dc:subject xml:lang="en">Kaplan-Meier</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en">D-penicillamine</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en">Log-Rank Test</dc:subject>
	<dc:subject xml:lang="en">Cirrhosis</dc:subject>
	<dc:description xml:lang="en">From 1974 to 1984, Mayo Clinic conducted a D-penicillamine trial to improve the chances of survival of PBC patients. Mayo Clinic conducted a randomized placebo-controlled trial on patients to compare D-penicillamine with D-penicillamine. Mayo Clinic considered other variables besides the time of death or censored time in its study, namely the variables of Ascites, Hepatomegaly, Spider or the presence of esophageal varices, and other PBC symptom variables. Therefore, the author conducted this study to find out D-penicillamine as a drug treatment for PBC by only looking at the variable of time of death or censored time and the variable of drug treatment received by patients during the ten-year data collection period and completing the study with statistical science. Based on that, the author used survival analysis with the Kaplan-Meier and Log-Rank methods to find D-penicillamine as a PBC drug treatment. This study shows how to complete the analysis using the R language. The study results showed that D-penicillamine treatment was not good enough to increase the survival chances of PBC patients</dc:description>
	<dc:description xml:lang="id">Pada tahun 1974 hingga 1984, Mayo Clinic mengumpulkan 424 pasien pengidap Primary Biliary Cirrhosis (PBC) untuk menguji apakah D-penicillamine dapat meningkatkan peluang tahan hidup pasien pengidap PBC. Mayo Clinic melakukan uji coba acak terkontrol placebo sebagai pembanding untuk D-penicillamine. Selain itu, terdapat pasien yang tidak diketahui treatment yang diberikan, tetapi tetap diobservasi sebagai pembanding sehingga terdapat tiga kelompok pasien pada penelitian tersebut, yakni pasien yang diberi treatment D-penicillamine, placebo, dan NA (pasien tidak diketahui treatment yang diberikan). Mayo Clinic memperhatikan variabel lain selain waktu kematian atau pun waktu tersensor pada penelitiannya, yaitu variabel gejala Asites, Hepatomegali, Spider atau adanya varises esofagus, dan variabel gejala PBC lainnya. Penulis melakukan penelitian pada skripsi ini dengan tujuan untuk mengetahui D-penicillamine sebagai treatment obat untuk penyakit PBC dengan hanya melihat variabel waktu kematian atau waktu tersensor dan variabel treatment obat yang didapatkan pasien selama masa pengumpulan data rentang sepuluh tahun tersebut serta menyelesaikan penelitian dengan ilmu statistika. Berdasarkan hal itu, penulis menggunakan analisis survival dengan metode Kaplan-Meier dan Log-Rank untuk mengetahui D-penicillamine sebagai treatment obat untuk penyakit PBC. Penelitian ini menunjukkan cara penyelesaian analisis tersebut menggunakan bahasa R. Hasil dari penelitian menunjukkan bahwa treatment D-penicillamine tidak cukup baik dalam meningkatkan peluang tahan hidup pasien pengidap PBC.</dc:description>
	<dc:publisher xml:lang="en">Department of Mathematics, Hasanuddin University</dc:publisher>
	<dc:date>2024-09-15</dc:date>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/article</dc:type>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
	<dc:format>application/pdf</dc:format>
	<dc:identifier>https://journal.unhas.ac.id/index.php/jmsk/article/view/36073</dc:identifier>
	<dc:identifier>10.20956/j.v21i1.36073</dc:identifier>
	<dc:source xml:lang="en">Jurnal Matematika, Statistika dan Komputasi; Vol. 21 No. 1 (2024): SEPTEMBER 2024; 285-306</dc:source>
	<dc:source>2614-8811</dc:source>
	<dc:source>1858-1382</dc:source>
	<dc:language>en</dc:language>
	<dc:relation>https://journal.unhas.ac.id/index.php/jmsk/article/view/36073/12015</dc:relation>
	<dc:relation>10.20956/j.v21i1.36073.g12015</dc:relation>
	<dc:rights xml:lang="en">Copyright (c) 2024 Jurnal Matematika, Statistika dan Komputasi</dc:rights>
	<dc:rights xml:lang="en">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</dc:rights>
</oai_dc:dc>