Melola Discovery

← Melola Discovery

Prosiding

AMPLIFIKASI GEN EF-1Α HAMA PENGGEREK BUAH KAKAO (Conopomorpha cramerella Snell.) DENGAN TEKNIK PCR DAN KARAKTERISASINYA

Prosiding Seminar Nasional Riset Kuantitatif Terapan 2017 · Vol. 1 No. 1 (2018)

Published
2018-02-10
Publisher
Prosiding Seminar Nasional Riset Kuantitatif Terapan 2017
Language
eng

Abstract

Tujuan penelitian ini adalah untuk mengamplifikasi dan menentukan karakter gen EF-1α hama kakao penggerek, PBK(Conopomorpha cramerella), sehingga dapat digunakan sebagai bahan informasi molekuler untuk deteksi dini PBK dengan PCR. Penelitian ini menggunakan metode PCR yang diawali dengan isolasi DNA genom menggunakan metode CTAB, analisis similaritasnukleotida dan protein menggunakan program NCBI, pemetaan enzim restriksi menggunakan program NEB Cutter, konstruksi pohon filogenetik menggunakan program Mafft Katoh, analisis asam amino menggunakan program Expasy, dan analisis hidrofobisitas menggunakan Program BioEdit. Hasil penelitian menunjukkan bahwa karakter fragmen gen EF-1α PBK parsial adalah berukuran 601 bp; fragmen gen EF-1α PBK parsial mempunyai nilai similaritas 100 % baik dianalisis berdasarkan urutan nukleotida maupun urutan asam amino; pemetaan enzim restriksi menunjukkan 42 situs pemotongan; analisis asam amino menghasilkan 200 asam amino; analisis hidrofobisitas menunjukkan bahwa gen parsial EF-1α adalah dominasi wilayah hidrofilik; dan hasil konstruksi filogenetik menunjukkan PBK berada pada kelompok yang sama dengan Conopomorpha cramerella. Berdasarkan karakter ini dapat disimpulkan bahwa sampel PBK termasuk dalam spesies Conopomorpha cramerella. Primer spesifik yang digunakan dalam PCR ini dapat mengamplifikasi fragmen DNA spesifik Conopomorpha cramerella sehingga metode ini dapat diterapkan sebagai alat deteksi Conopomorpha cramerella.Kata kunci— Conopomorpha cramerella, PBK, genEF-1α, Kakao.

Collaboration network of the authors

32 authors · 91 co-authorship links · 1 across different organisations

Hover or tap a name to highlight its co-authors. Double-click to open the author's page.

  • Universitas Halu Oleo
  • Jordan University of Science and Technology
  • Universitas Muslim Buton
  • Affiliation unknown
  • Different organisations
  • Same organisation
  • Affiliation unknown
  • Thicker line = more joint articles · bigger circle = more articles
Show as table
Co-authorOrganisationJoint articles
Suriana SurianaAffiliation unknown2
Jahidin JahidinAffiliation unknown2
Ahmad MustafaJordan University of Science and Technology1
Ma’ruf KasimUniversitas Halu Oleo1
Abdul Muis BalubiAffiliation unknown1
Wardha JalilAffiliation unknown1
Yusnaini YusnainiUniversitas Halu Oleo1
Muh Yamin EffendieAffiliation unknown1
Alias AliasAffiliation unknown1
Barti BartiAffiliation unknown1
La Ode KaharudinUniversitas Muslim Buton1
Fahyuddin FahyuddinAffiliation unknown1
Asriwaty AsriwatyAffiliation unknown1
La HasaniAffiliation unknown1
Safilu SafiluAffiliation unknown1
Hadijah HadijahAffiliation unknown1
Nur Arfa YantiAffiliation unknown1
Haidin HaidinAffiliation unknown1
Dirvamena BoerUniversitas Halu Oleo1
Warhamni WarhamniAffiliation unknown1
Asrul SaniAffiliation unknown1
Sahidin SahidinAffiliation unknown1
Wahyuni WahyuniAffiliation unknown1
Adryan FristiohadyAffiliation unknown1
Mentarry BafadalAffiliation unknown1
Vica AspadiahAffiliation unknown1
Rina AndrianiAffiliation unknown1
Rizky Barkah RamadhaniAffiliation unknown1
Puspita SariAffiliation unknown1
SRI WAHYUNIAffiliation unknown1
Wa AbeAffiliation unknown1

Affiliations come from OpenAlex; journal OAI-PMH metadata carries none. Authors without an OpenAlex ID are matched by name, which can merge or split people.

Metadata source: OAI-PMH (metadata jurnal) https://ojs.uho.ac.id/index.php/snrkt2017/oai, first harvested 30 Okt 2026, last seen 1 Nov 2026.
Original metadata (oai_dc) 
<oai_dc:dc xmlns="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/  http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">
	<dc:title xml:lang="en-US">AMPLIFIKASI GEN EF-1Α HAMA PENGGEREK BUAH KAKAO (Conopomorpha cramerella Snell.) DENGAN TEKNIK PCR DAN KARAKTERISASINYA</dc:title>
	<dc:creator>Muzuni, Muzuni</dc:creator>
	<dc:description xml:lang="en-US">Tujuan penelitian ini adalah untuk mengamplifikasi dan menentukan karakter gen EF-1α hama kakao penggerek, PBK(Conopomorpha cramerella), sehingga dapat digunakan sebagai bahan informasi molekuler untuk deteksi dini PBK dengan PCR. Penelitian ini menggunakan metode PCR yang diawali dengan isolasi DNA genom menggunakan metode CTAB, analisis similaritasnukleotida dan protein menggunakan program NCBI, pemetaan enzim restriksi menggunakan program NEB Cutter, konstruksi pohon filogenetik menggunakan program Mafft Katoh, analisis asam amino menggunakan program Expasy, dan analisis hidrofobisitas menggunakan Program BioEdit. Hasil penelitian menunjukkan bahwa karakter fragmen gen EF-1α PBK parsial adalah berukuran 601 bp; fragmen gen EF-1α PBK parsial mempunyai nilai similaritas 100 % baik dianalisis berdasarkan urutan nukleotida maupun urutan asam amino; pemetaan enzim restriksi menunjukkan 42 situs pemotongan; analisis asam amino menghasilkan 200 asam amino; analisis hidrofobisitas menunjukkan bahwa gen parsial EF-1α adalah dominasi wilayah hidrofilik; dan hasil konstruksi filogenetik menunjukkan PBK berada pada kelompok yang sama dengan Conopomorpha cramerella. Berdasarkan karakter ini dapat disimpulkan bahwa sampel PBK termasuk dalam spesies Conopomorpha cramerella. Primer spesifik yang digunakan dalam PCR ini dapat mengamplifikasi fragmen DNA spesifik Conopomorpha cramerella sehingga metode ini dapat diterapkan sebagai alat deteksi Conopomorpha cramerella.Kata kunci— Conopomorpha cramerella, PBK, genEF-1α, Kakao.</dc:description>
	<dc:publisher xml:lang="en-US">Prosiding Seminar Nasional Riset Kuantitatif Terapan 2017</dc:publisher>
	<dc:contributor xml:lang="en-US"></dc:contributor>
	<dc:date>2018-02-10</dc:date>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/article</dc:type>
	<dc:type>info:eu-repo/semantics/publishedVersion</dc:type>
	<dc:type xml:lang="en-US">Peer-reviewed Article</dc:type>
	<dc:format>application/pdf</dc:format>
	<dc:identifier>https://ojs.uho.ac.id/index.php/snrkt2017/article/view/3538</dc:identifier>
	<dc:source xml:lang="en-US">Prosiding Seminar Nasional Riset Kuantitatif Terapan 2017; Vol 1, No 1 (2017): Seminar Nasional Riset Kuantitatif Terapan 2017</dc:source>
	<dc:language>eng</dc:language>
	<dc:relation>https://ojs.uho.ac.id/index.php/snrkt2017/article/view/3538/2676</dc:relation>
	<dc:rights xml:lang="en-US">Copyright (c) 2018 Prosiding Seminar Nasional Riset Kuantitatif Terapan 2017</dc:rights>
</oai_dc:dc>